生物化学农药是指同时满足下列两个条件的农药:一是对防治对象没有直接毒性，而只有调节生长、干扰交配或引诱等特殊作用；二是天然化合物，如果是人工合成的，其结构应与天然化合物相同(允许构体比例的差异)。主要包括以下类别:
(1) 化学信息物质，是指由动植物分泌的，能改变同种或不同种受体生物行为的化学物质。(2) 天然植物生长调节剂，是指由植物或微生物产生的，对同种或不同种植物的生长发育(包括萌发、生长、开花、受精、坐果、成熟及脱落)具有抑制、刺激等作用或调节植物抗逆境(寒、热、旱、湿、风、病虫害)的化学物质。(3) 天然昆虫生长调节剂，是指由昆虫产生的对昆虫生长过程具有抑制、刺激等作用的化学物质。(4) 天然植物诱抗剂，是指能够诱导植物对有害生物侵染产生防卫反应、提高其抗性的天然源物质。(5) 其他生物化学农药，是指除上述以外的其他满足生物化学农药定义的物质。以下几种农药，是否按照生物农药提交登记资料有特殊要求：- 氯化胆碱：由胆碱季铵盐正离子与氯负离子组成，胆碱季铵盐正离子为生物体内天然存在，氯负离子为自然界普遍存在；氯化胆碱在我国可作为食品营养强化剂、饲料添加剂使用，对人、动物和环境安全；美国EPA将氯化胆碱列为生物化学农药。据此，将氯化胆碱列为生物化学农药。
- 丙酰芸苔素内酯：是芸苔素内酯的衍生物，芸苔素内酯分子结构的2,3位羟基酰化和22,23位的羟基氧化，其毒理学差异不明确，暂不列为生物化学农药。
- 乙烯利：进入植物体内实际起作用的物质为乙烯，但其结构与乙烯不同，不能视为同一种物质。因此不归为生物化学农药。
- 萘乙酸：为类生长素物质，人工合成而成，美国EPA生物农药网站也无该有效成分，目前无充足资料证明为生物化学农药。
- 甲萘灵：为许多植物自身产生的一种激素类物质，属植物体内天然存在的化合物，符合我国生物化学农药的定义，甲萘灵在美国等国家已作为生物化学农药取得登记。据此将甲萘灵按生物化学农药登记。