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北京市农林科学院解析重要果树害虫桃小食心虫基因组
来源:农化专利网   发布时间:2021-02-10 10:01
简述
桃小食心虫是苹果、梨、桃等果树上的重要害虫,生产上主要通过套袋进行防控,由于缺乏有效防控措施,该虫的危害成为当前制约果实免套袋栽培的重要因素。国内外科研人员主要从发生动态、滞育特性、遗传分化及环境适应性等方面进行研究,其高质量基因组的解析将进一步推动相关领域的研究进展,以期为该虫的预测预报和防控技术研究提供科学依据。

桃小食心虫是苹果、梨、桃等果树上的重要害虫,生产上主要通过套袋进行防控,由于缺乏有效防控措施,该虫的危害成为当前制约果实免套袋栽培的重要因素。国内外科研人员主要从发生动态、滞育特性、遗传分化及环境适应性等方面进行研究,其高质量基因组的解析将进一步推动相关领域的研究进展,以期为该虫的预测预报和防控技术研究提供科学依据。

北京市农科院植环所曹利军博士等研究人员采用Illumina、PacBio测序平台和Hi-C技术对桃小食心虫基因组进行测序,通过团队搭建的分析流程完成了染色体水平的基因组组装和注释,获得30条常染色体和一条Z染色体,BUSCO评估完整度为98.3%。对昼夜节律基因、解毒基因和化学受体基因家族进行了注释,发现桃小食心虫除了谷胱甘肽S-转移酶(GST)基因的数量较多以外,其他解毒基因家族基因数量和化学受体基因数量均低于大部分鳞翅目昆虫。这是目前测定的第一个蛀果蛾科昆虫的全基因组,丰富了大家对鳞翅目昆虫基因组特征与演化的认识。


该研究论文在国际知名刊物《Molecular Ecology Resources》上发表,基因组数据已在NCBI数据库公开。