本发明公开了一种防治小麦赤霉病的复配剂，包含氟环唑和咯菌腈的可湿性粉剂、胶悬剂、微乳剂、水分散颗粒剂或颗粒剂。上述防治小麦赤霉病的复配剂在防治小麦赤霉病上的应用，每次按照每公顷中氟环唑和咯菌腈总有效量30g和30~150g的用量，兑水600kg，叶面喷施。本发明的优点在于：复配药剂中的氟环唑和咯菌腈分别为不同作用机理的杀菌剂，与防治小麦赤霉病的当家药剂多菌灵和三唑酮间无交互抗药性，该制剂杀菌谱广、内吸性强、速效性好、持效期长，对环境友好且具要成本低和加工简易的优点。