本发明属于农药技术领域,具体的说是涉及一种防治水稻细菌性条斑病的杀菌组合物。一种防治水稻细菌性条斑病的杀菌组合物,其由有效成分为小檗碱和肟醚菌胺复配而成,所述小檗碱和肟醚菌胺的质量比是1‑20:20‑1。本发明的杀菌组合物可制备成可湿性粉剂、水分散粒剂、悬浮剂、微囊悬浮剂、颗粒剂或水乳剂等农药学中的常规剂型。本发明的杀菌剂组合物具有高效、环境污染性小,延缓病菌抗药性产生等优点,该杀菌组合物可用于防治多种作物的病害,尤其是水稻细菌性条斑病。