本发明属于农药技术领域，具体的说是涉及一种水稻杀菌组合物。一种水稻杀菌组合物，其由有效成分为小檗碱和叶菌唑复配而成，所述小檗碱和叶菌唑的质量比是1‑10:10‑1。本发明的杀菌组合物可制备成可湿性粉剂、水分散粒剂、悬浮剂、微囊悬浮剂、颗粒剂或水乳剂等农药学中的常规剂型。本发明的杀菌剂组合物具有高效、环境污染性小，延缓病菌抗药性产生等优点，该杀菌组合物可用于防治多种作物的病害，尤其是水稻细菌性条斑病。